Albanne LECOINTRE

Ingénieur de Recherche CNRS en calcul scientifique intensif lié aux activités de fouille de données massives.

Equipe de rattachement : Ondes et Structures

Groupe technique : GeoData

ORCID iD : 0000-0002-8255-5338

Missions :

– Définir et mettre en oeuvre des méthodes mathématiques et des moyens techniques informatiques pour la fouille de données géophysiques massives.
– Concevoir, prototyper, évaluer, déployer ces solutions méthodologiques et logicielles sur les infrastructures de calcul et de stockage du mésocentre GriCAD.
– Animatrice du Groupe Tranversal CaDo (Calcul & Données) de l’ISTerre.
– Membre du comité de programme du Réseau Thématique (GdR INSU) NUTS (NUmérique pour la Terre Solide)
– Collaboratrice externe à l’UAR GriCAD (lettre de mission 10% de temps)
– Pilotage scientifique du projet IWORMS.
– Responsable technique du projet DataContainerEvaluation
– Support technique aux projets de recherche F-Image, RESOLVE, OptCorr, ...

Activités :

Développement logiciel et Production :

Lien vers l’activité Fouille de Données du service GeoData

Projet DataContainerEvaluation

This project aims at testing :
– data formats (HDF5, zarr, ...),
– dataset layout : datatypes F32 & I32, datadims, dataset chunking, dataset compression (standards, Blosc, Blosc2, ...), dataset prefiltering (bytewise & bitwise shuffling, delta, trunc_prec)...),
– and data storage strategies (Summer NetApp S3 for distribution, BeeGFS /silenus for HPC) ;
for seismic data distribution and HPC.

Projet OptCorr : L’objectif de ce projet est de prototyper une méthode déterministe et analytique pour la mesure de déplacements d’échelle sub-pixel entre deux images 2D (par exemple mesure des déplacements du sol dont l’amplitude est inférieure au pixel). Par itérations successives sur des paires de sub-images locales, on calcule une corrélation 2D discrète, que l’on fitte par une fonction continue : fonction objectif dépendante de différents paramètres (déplacements horizontal et vertical, caractère d’anisotropie, facteur d’amplification, ...). Le best-fit renseigne les paramètres optimaux retenus pour décrire le "déplacement", ainsi que l’incertitude liée à l’optimisation. Les jeux de données test utilisés sont de différents types : PIV (Vélocimétrie par Image de Particules : données du projet ImVort), images GeoTiff du séisme du Balochistan (Pakistan) 2013.

Projet iWORMS : Les objectifs de ce projet interdisciplinaire (LJK, ISTerre, GriCAD) sont (1) de mettre en œuvre une nouvelle méthode de correction de la datation basée sur l’inter-corrélation de bruit sismique ambiant (2) d’appliquer ce traitement à des flux continus de données.

Projet RESOLVE : Ce projet interdisciplinaire (IGE, ISTerre, LIG) étudie les données acquises sur le glacier d’Argentière au printemps 2018 (RESIF ZO_2018 dataset). Les objectifs sont de développer un code de calcul des localisations MFP (Matched Field Processing), d’effectuer ce calcul sur la grille de calcul CiGri et de développer un outil de visualisation des résultats multiparamétriques (x,y,z,c,f,t) issues de ces localisations. Les outils développés dans le cadre de ce projet sont utilisés pour le projet SPIN ITN (Cuolm da Vi landslide, ETH Zürich), le projet Glacier de Tête Rousse (ISTerre équipe Mécanique des Failles), le projet SEIS-ADELICE (Glacier de l’Astrolabe-Antarctique, IGE) et les projets SLIDE, REASSESS, SEISMORIVGLA (Glacier de Isuunguata-Groenland, IGE). Le traitement de données du Glacier de Isuunguata-Groenland a servi de support pour le test de campagne massive de traitement de données via la grille CiGri sur les 2 nouveaux (2025) supercalculateurs kraken-cpu et kraken-gpu (freeride MFP-CiGri lors de l’été 2025)

Projet F-Image : développement et déploiement d’un code de calcul des variations de vitesses de phase sismiques (dv/v), mise en oeuvre sur les données Japonaises du réseau Hi-Net, les données du réseau YH (Dense Array for North Anatolia), les données Californienne, ...

Projet San Jacinto / Imag’in : Calculs de double-beamforming et de corrélations avec des données d’acquisition sismique autour de la faille de San Jacinto (Californie du Sud). DOI ZG_2014 dataset.

Support

J’assure le support utilisateurs pour l’utilisation des codes (compilation, exécution) sur machines locales (laboratoire) ou régionales (mésocentre CIMENT-GriCAD), ainsi que pour l’exploitation des volumes de données générés (formats de données, lecture et visualisation, partage et archivage).

– Lien vers support pour le partage de données vers l’extérieur du site

– Lien vers support pour l’archivage semi-pérenne (pas de rétention) de données vers les ressources de sauvegarde irods-mantis-backup

Enseignement

J’interviens dans le cours d’introduction au calcul parallèle du Collège des Ecoles Doctorales / MaiMoSiNE pour les modules MPI : Programmation parallèle par échange de message, Entrées-Sorties parallèles MPI-IO & parallelHDF5, Calcul sur Grille CiGri.

– Lien vers le contenu de la formation Bloc Outils Numériques (accès restreint aux utilisateurs authentifiés sur la forge GitLab GriCAD) :
– Introduction au calcul parallèle
– Introduction aux formats de données et à la visualisation en calcul scientifique - Entrée-sorties parallèles

– Lien vers le tutoriel Calcul sur Grille CiGri (accès restreint aux utilisateurs authentifiés sur la forge GitLab GriCAD)

– Lien vers les supports de la formation interne HDF5 dispensée en 2015 pour les personnels RESIF, SIG, IPGP

– Lien vers l’Offre de Formation portée par les groupes CaDo-GeoData de l’ISTerre